{"id":1564,"date":"2016-05-28T12:36:22","date_gmt":"2016-05-28T11:36:22","guid":{"rendered":"http:\/\/nyuz.elte.hu\/?p=1564"},"modified":"2016-05-28T12:36:22","modified_gmt":"2016-05-28T11:36:22","slug":"bioinformatikai-eloadasok-az-elte-n-embo-kurzus","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/nyuz.elte.hu\/?p=1564","title":{"rendered":"Bioinformatikai el\u0151ad\u00e1sok az ELTE-n \u2013 EMBO kurzus"},"content":{"rendered":"

M\u00e1jus 30. \u00e9s j\u00fanius 4. k\u00f6z\u00f6tt egy egyhetes kurzusnak ad otthont az ELTE L\u00e1nym\u00e1nyosi Campusa, amely a feh\u00e9rje-feh\u00e9rje kapcsolatok sz\u00e1m\u00edt\u00f3g\u00e9pes anal\u00edzise k\u00f6r\u00e9 \u00e9p\u00fcl bioinformatikai \u00e9s rendszerbiol\u00f3giai szempontb\u00f3l.<\/strong><\/p>\n

A kutat\u00f3knak sz\u00f3l\u00f3 kurzus utazik a vil\u00e1gban. Keveseknek adatik meg a lehet\u0151s\u00e9g, hogy r\u00e9szt vegyenek rajta, b\u00e1r sokan jelentkeznek minden \u00e9vben, mert olyan vezet\u0151 bioinformatikai szakemberek \u00e9s oktat\u00f3k tartj\u00e1k, akik maguk is akt\u00edvan r\u00e9szt vettek a feh\u00e9rj\u00e9k \u00e9s azok k\u00f6lcs\u00f6nhatas\u00e1inak felt\u00e9rk\u00e9pez\u00e9shez sz\u00fcks\u00e9ges alapvet\u0151 bioinformatikai eszk\u00f6z\u00f6k kifejleszt\u00e9s\u00e9ben A kurzus z\u00e1rtk\u00f6r\u0171, \u00e9s sajnos csak n\u00e9gy magyar kutat\u00f3nak lehetett helyet biztos\u00edtani, azonban a plen\u00e1ris el\u0151ad\u00e1sok \u00e9s az unseminar szabadon l\u00e1togathat\u00f3k. Erre szeretn\u00e9nk most invit\u00e1lni Titeket!<\/p>\n

Mir\u0151l sz\u00f3lnak a plen\u00e1ris el\u0151ad\u00e1sok?<\/strong><\/p>\n

H\u00e1rom plen\u00e1ris el\u0151ad\u00e1s lesz. M\u00e1jus 30-\u00e1n, 16:00-t\u00f3l Lars Juhl Jensen<\/strong> besz\u00e9l nek\u00fcnk az orvosi adatb\u00e1ny\u00e1szatr\u00f3l \u00e9s a h\u00e1l\u00f3zatos megk\u00f6zel\u00edt\u00e9s el\u0151nyeir\u0151l. Betegs\u00e9gek, gy\u00f3gyszerek \u00e9s mell\u00e9khat\u00e1sok kapcsolatair\u00f3l is lesz sz\u00f3 az el\u0151ad\u00e1s hatvan perc\u00e9ben. Az el\u0151ad\u00f3 neve f\u00e9mjelzi a STRING \u00e9s STITCH adatb\u00e1zisokat, melyekben feh\u00e9rj\u00e9k \u00e9s egy\u00e9b molekul\u00e1k, ut\u00f3bbiban kifejezetten kismolekul\u00e1k h\u00e1l\u00f3zati kapcsolatait \u00edrj\u00e1k le, mely inform\u00e1ci\u00f3k a gy\u00f3gyszerfejleszt\u00e9sben hasznosulnak. Nagy mennyis\u00e9g\u0171 klinikai adat elemz\u00e9s\u00e9nek neh\u00e9zs\u00e9geir\u0151l \u00e9s lehet\u0151s\u00e9geir\u0151l hallhatunk ezen a plen\u00e1ris el\u0151ad\u00e1son.<\/p>\n

M\u00e1jus 31-\u00e9n, 16:00-t\u00f3l hallhatjuk Ora Schueler-Furman<\/strong> el\u0151ad\u00e1s\u00e1t, melyben a feh\u00e9rje-feh\u00e9rje interakci\u00f3k in silico<\/em> modellez\u00e9s\u00e9r\u0151l lesz sz\u00f3. Ora r\u00e9szt vett a ROSETTA feh\u00e9rjet\u00e9rszerkezet-becsl\u0151 program kidolgoz\u00e1s\u00e1ban, amely alapj\u00e1n feh\u00e9rjehajtogat\u00f3s videoj\u00e1t\u00e9k is k\u00e9sz\u00fclt. A feh\u00e9rj\u00e9k h\u00e1rom dimenzi\u00f3s szerkezetei kapcsol\u00f3d\u00e1s\u00e1nak modellez\u00e9se r\u00e9v\u00e9n meg\u00e9rthej\u00fck, hogy k\u00fcldenek SMS-t a feh\u00e9rj\u00e9k egym\u00e1s k\u00f6z\u00f6tt. El\u0151ad\u00e1sa, amelynek c\u00edme: SMS in protein communication: How Short Motif Sequences are read and understood, egyben a Szentgy\u00f6rgyi-el\u0151ad\u00e1ssorozat r\u00e9sze is.<\/p>\n

J\u00fanius 1-\u00e9n, 16:00-t\u00f3l a Toby Gibson<\/strong>, az EMBL (European Molecular Biology Laboratory) egyik molekul\u00e1ris biol\u00f3giai kutat\u00f3csoportj\u00e1nak vezet\u0151je tart el\u0151ad\u00e1st a feh\u00e9rj\u00e9k modul\u00e1ris szerkezet\u00e9r\u0151l \u00e9s a sejt szab\u00e1lyoz\u00f3 mechanizmusainak m\u0171k\u00f6d\u00e9s\u00e9r\u0151l. Az el\u0151ad\u00f3 a feh\u00e9rje-t\u00e9rszerkezet \u00e9s -funkci\u00f3 k\u00f6z\u00f6tti kapcsolat felder\u00edt\u00e9s\u00e9nek vil\u00e1gh\u00edr\u0171 szakembere. \u00daj megk\u00f6zel\u00edt\u00e9ssel l\u00e9trehozott adatb\u00e1zisa tartalmazza az eukari\u00f3ta feh\u00e9rj\u00e9k line\u00e1ris mot\u00edvumait, ezzel lehet\u0151v\u00e9 teszi olyan apr\u00f3 funkcion\u00e1lis modulok felismer\u00e9s\u00e9t, amelyek alapvet\u0151 szab\u00e1lyoz\u00e1si folyamatokban vesznek r\u00e9szt. Ezek a line\u00e1ris mot\u00edvumok hat\u00e1rozz\u00e1k meg a kin\u00e1zok \u00e9s foszfat\u00e1zok c\u00e9lpontjait, vagyis hogy egy feh\u00e9rje mikor \u00e9s hol lesz akt\u00edv a sejtben, vagy hogy mikor ker\u00fcl lebont\u00e1sra.<\/p>\n

Mindh\u00e1rom el\u0151ad\u00e1s helysz\u00edne a Szab\u00f3 J\u00f3zsef el\u0151ad\u00f3terem.<\/p>\n

\"12953_2013_Article_459_Fig1_HTML\"<\/a><\/p>\n

Mi is az az unseminar?<\/strong><\/p>\n

Az unseminar egy k\u00f6z\u00f6ss\u00e9gi esem\u00e9ny, amely m\u00e1jus 31-\u00e9n, 19:00-kor kezd\u0151dik a f\u00f6ldszinti Ar\u00e9n\u00e1ban. C\u00e9lja a bioinformatikai k\u00f6z\u00f6ss\u00e9g \u00f6sszekov\u00e1csol\u00e1sa, hogy k\u00f6tetlen besz\u00e9lget\u00e9s keret\u00e9n bel\u00fcl \u00f6tletek, ismeretek cser\u00e9ljenek gazd\u00e1t, mik\u00f6zben szem\u00e9lyes kapcsolatok alakulnak ki, amelyek ak\u00e1r j\u00f6v\u0151beli kollabor\u00e1ci\u00f3k form\u00e1j\u00e1ban is manifeszt\u00e1l\u00f3dhatnak. Az esem\u00e9ny els\u0151dleges c\u00e9lja a k\u00f6tetlen hangulat kialak\u00edt\u00e1sa, ez\u00e9rt a tervek szerint (a speed-dating m\u00f3dszert alapul vev\u0151) speed networking nyitja a sze\u00e1nszot. Majd kis csoportok alakulnak, amelyekben a r\u00e9sztvev\u0151k megbesz\u00e9lhetik, \u00f6sszehasonl\u00edthatj\u00e1k, megvitathatj\u00e1k az \u00e1ltaluk haszn\u00e1lt k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 m\u00f3dszerek el\u0151nyeit \u00e9s h\u00e1tr\u00e1nyait.<\/p>\n

Az unseminar jelens\u00e9ge Aidan Budd<\/strong> nev\u00e9hez f\u0171z\u0151dik. Aiden hivat\u00e1sos k\u00f6z\u00f6ss\u00e9g\u00e9p\u00edt\u0151 a heidelbergi EMBL kutat\u00f3int\u00e9zetben, \u00e9s fontosnak tartja, hogy a kutat\u00f3int\u00e9zet szakemberei ne csak hivatalos keretek k\u00f6zt tal\u00e1lkozzanak egym\u00e1ssal. A tal\u00e1lkoz\u00e1s c\u00e9lja egyben az open science szellemis\u00e9g\u00e9be t\u00f6rt\u00e9n\u0151 bevon\u00e1s is, miszerint a tud\u00e1s mindenki\u00e9. Aki eddig nem \u00e9rdekl\u0151d\u00f6tt a bioinformatika ir\u00e1nt, az ezen az esem\u00e9nyen sz\u00e1mos bioinformatikai eszk\u00f6zzel \u00e9s egy\u00e9b sz\u00e1m\u00edt\u00f3g\u00e9pes applik\u00e1ci\u00f3val ismerkedhet meg, amelyek sz\u00e1m\u00e1ra is fontosak lehetnek. Aki m\u00e1r bioinformatik\u00e1val foglalkozik, az pedig tov\u00e1bb b\u0151v\u00edtheti ismereteit az el\u00e9rhet\u0151 tudom\u00e1nyos szersz\u00e1mk\u00e9szletr\u0151l.<\/p>\n

EMBL szimp\u00f3zium<\/strong><\/p>\n

Mindezen fel\u00fcl j\u00fanius m\u00e1sodik\u00e1n d\u00e9lut\u00e1n zajlik majd az EMBL szimp\u00f3zium, amelyet Buday L\u00e1szl\u00f3<\/strong>, az MTA TTK Enzimol\u00f3giai Int\u00e9zet igazgat\u00f3ja nyit majd meg. A d\u00e9lut\u00e1n sor\u00e1n betekint\u00e9st nyerhet\u00fcnk az EMBL \u00e9s a magyar kutat\u00e1s k\u00f6z\u00f6s jelen\u00e9be \u00e9s j\u00f6v\u0151j\u00e9be, illetve f\u00e9l \u00f3r\u00e1s el\u0151ad\u00e1sokat hallhatunk k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 izgalmas t\u00e9m\u00e1kban. Az els\u0151 el\u0151ad\u00e1son Toby Gibson fog besz\u00e9lni a patog\u00e9n feh\u00e9rje mot\u00edvumok mimikrij\u00e9r\u0151l, majd Barab\u00e1s Orsoly\u00e1t<\/strong> hallgathatjuk meg, aki az ugr\u00e1l\u00f3 g\u00e9nek m\u0171k\u00f6d\u00e9si mechanizmusair\u00f3l tart el\u0151ad\u00e1st. Harmadikk\u00e9nt Lars Juhl Jensen-t\u0151l tudhatunk meg t\u00f6bbet a g\u00e9nek h\u00e1l\u00f3zat\u00e1r\u00f3l.<\/p>\n

Mi\u00e9rt vegyek r\u00e9szt ezeken az esem\u00e9nyeken?<\/strong><\/p>\n

Mert a vil\u00e1g \u00e9lvonal\u00e1ba tartoz\u00f3 kutat\u00f3k mutatj\u00e1k be a kutat\u00e1si ter\u00fcleteik forr\u00f3 pontjait, amelyek ment\u00e9n form\u00e1l\u00f3dik a tudom\u00e1ny. Mert ritka alkalom, hogy ilyen nagyszab\u00e1s\u00fa rendezv\u00e9nyt szerveznek Magyarorsz\u00e1gon, \u00e9s ez v\u00e9letlen\u00fcl \u00e9ppen a mi \u00e9p\u00fclet\u00fcnkben zajlik majd. Mert egy ilyen rendezv\u00e9nyen b\u00e1rmi el\u0151fordulhat, ak\u00e1r a j\u00f6vend\u0151 t\u00e9mavezet\u0151det is megismerheted. Mert a kurzus, az el\u0151ad\u00e1sok \u00e9s az unseminar is angolul zajlik, \u00edgy v\u00e1lik ez az esem\u00e9ny alkalmas helysz\u00ednn\u00e9 ahhoz, hogy gyakorold a szakmai angolt.<\/p>\n

Tov\u00e1bbi inform\u00e1ci\u00f3k a http:\/\/dosztanyi.web.elte.hu\/<\/a>embo.html oldalon tal\u00e1lhat\u00f3k.<\/p>\n

Cs\u00edkosfej\u0171 n\u00e1diposz\u00e1ta<\/strong><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

M\u00e1jus 30. \u00e9s j\u00fanius 4. k\u00f6z\u00f6tt egy egyhetes kurzusnak ad otthont az ELTE L\u00e1nym\u00e1nyosi Campusa, amely a feh\u00e9rje-feh\u00e9rje kapcsolatok sz\u00e1m\u00edt\u00f3g\u00e9pes anal\u00edzise k\u00f6r\u00e9 \u00e9p\u00fcl bioinformatikai \u00e9s rendszerbiol\u00f3giai szempontb\u00f3l.<\/p>\n","protected":false},"author":53,"featured_media":1565,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1,57],"tags":[47,385,384,78,80,117],"class_list":["post-1564","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-foldal","category-tudositas","tag-ajanlo","tag-bioinformatika","tag-embo","tag-nyuz","tag-tetekas","tag-tudositas"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/nyuz.elte.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/1564"}],"collection":[{"href":"https:\/\/nyuz.elte.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/nyuz.elte.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/nyuz.elte.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/53"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/nyuz.elte.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=1564"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/nyuz.elte.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/1564\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":1566,"href":"https:\/\/nyuz.elte.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/1564\/revisions\/1566"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/nyuz.elte.hu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/media\/1565"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/nyuz.elte.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=1564"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/nyuz.elte.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=1564"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/nyuz.elte.hu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=1564"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}